امید به انتها تمام بیماری ها به یاری هوش مصنوعی - وبلاگ خلیج اپ

به گزارش وبلاگ خلیج اپ، پایگاه داده ساختار پروتئین شرکت الفبت موسوم به آلفا فولد اکنون شامل بیش از 200 میلیون پروتئین شناخته شده است که امیدها را برای درمان انواع بیماری ها زنده نگه می دارد.

به گزارش وبلاگ خلیج اپ ، ایسنا به نقل از نیو اطلس گزارش داده، سال گذشته، هوش مصنوعی شرکت الفبت(Alphabet) به نام دیپ مایند(DeepMind)، یک پایگاه داده منبع باز از ساختارهای سه بعدی صدها هزار پروتئین از جمله تمام 20 هزار پروتئین شناخته شده در بدن انسان منتشر کرد. اکنون این پایگاه داده موسوم به آلفا فولد به 200 میلیون نمونه پیشرفته است که تقریباً می توان گفت تمام پروتئین های شناخته شده در جهانی علم را شامل می شود.

پروتئین ها عامل فعالیت سلول های زنده هستند که تعداد بی شماری از فرآیندهای بیولوژیکی حیاتی در راه حیات را انجام می دهند. آنها از زنجیره ای از اسیدهای آمینه تشکیل شده اند که به شکل های سه بعدی پیچیده می شوند که عملکرد آنها را دیکته می کند. ترسیم ساختار پروتئین ها برای درک اینکه چه کاری انجام می دهند، چگونه کار می کنند و اینکه چگونه ممکن است چیزی اشتباه پیش برود، مهم است. شناخت و ترسیم پروتئین ها برای تحقیق در مورد همه چیز، از داروها و درمان های نو گرفته تا بهبود محصولات کشاورزی و حفاظت از حیوانات، کلیدی است.

اما محاسبه ساختار دقیق یک پروتئین بر اساس اسیدهای آمینه تشکیل دهنده آن سخت است. پی بردن به این موضوع معمولاً به اندازه زیادی قدرت محاسباتی و ساعات کار سرسام آور انسانی نیاز دارد، در حالی که این شرایط به مشکل تاخوردگی پروتئین معروف شده است. به این ترتیب، پیشرفت در این حوزه در طول دهه های اخیر نسبتاً کند بوده است.

اکنون می توان گفت این مشکل تا زمانی مشکل بود که شرکت الفبت که شرکت مادر گوگل است، هنوز هوش مصنوعی قدرتمند خود موسوم به دیپ مایند را روی این مشکل تنظیم نکرده بود. این سیستم که در ابتدا با 100 هزار ساختار پروتئینی شناخته شده آموزش دیده بود، توانایی پیش بینی ساختار میلیون ها پروتئین دیگر را توسعه داد که تعیین و ترسیم هر یک از آنها به جای ماه ها یا سال ها، تنها چند دقیقه یا چند ثانیه زمان می برد.

نوترین مطالب

حمایت ناسا از پروژه 3 محقق ایرانی

تشخیص بیماری قلبی با هوش مصنوعی

ابتکار پزشک ایرانی-کانادایی در کاهش عوارض جانبی جراحی ها

تشخیص اخبار گمراه کننده از طریق هوش مصنوعی

در ژوئیه 2021 اولین پایگاه داده ساختار پروتئین آلفا فولد برای عموم منتشر شد. این پایگاه داده در ابتدا حاوی بیش از 350 هزار ساختار پروتئینی بود که حدود 98.5 درصد از پروتئین های انسانی و همچنین پروتئین های موجود در مگس های میوه، موش ها، مخمرها و باکتری های ای.کولی(E.coli) را شامل می شد. بعدها به حدود یک میلیون ساختار پروتئینی از 10 هزار گونه جانوری، گیاه، باکتری، قارچ و سایر موجودات توسعه یافت.

حالا ظرف یک سال پس از آن رویداد، بیش از 500 هزار دانشمند از سراسر جهان برای کمک گرفتن در تحقیقات خود به این پایگاه داده دسترسی پیدا کرده اند.

اکنون دیپ مایند یک به روزرسانی بزرگ نو برای پایگاه داده خود منتشر کرده است که در حال حاضر شامل حدود 214 میلیون ساختار از یک میلیون گونه است. این عدد یعنی تقریباً تمام پروتئین هایی را که در حال حاضر برای علم شناخته شده است، پوشش می دهد و برای تحقیق در مورد درمان بیماری ها، واکسن ها، پایداری، مقاومت آنتی بیوتیکی و حتی آلودگی پلاستیکی موهبت بزرگی را ارائه می دهد.

اریک توپول، مدیر مؤسسه تحقیقاتی اسکریپس می گوید: آلفا فولد قبلاً اکتشافات عظیمی از جمله شکستن ساختار مجتمع منافذ هسته ای را تسریع و فعال کرده است و با افزودن این ساختارهای نو که تقریباً کل جهان پروتئین ها را روشن می کند، می توانیم انتظار داشته باشیم که اسرار بیولوژیکی بیشتری هر روز رمزگشایی شود.

گفتنی است که کل پایگاه داده ساختارهای پروتئین، متشکل از بیش از 25 ترابایت داده را می توان از مجموعه داده های عمومی Google Cloud دانلود کرد.